Фамилия Подзеракина — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа — «подзерак» — в современном русском языке не встречается, поэтому разгадку приходится искать в диалектах, старых названиях ремёсел или искажённых формах других слов.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Подзерака, которое дали человеку с характерной манерой поведения или особым занятием. Вероятнее всего, оно связано с глаголом «зреть» (смотреть, видеть) и приставкой «под-». В таком случае «подзерака» — это тот, кто подсматривает, подглядывает, возможно, наблюдатель или дозорный. В некоторых говорах «подзирать» означало «присматривать, надзирать». Тогда прозвище могло относиться к сторожу, пастуху или человеку, который следил за порядком.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «зерак» (или «зирак») — так в некоторых регионах называли вид рыбы или мелкое животное. В этом случае «подзерака» — тот, кто ловит такую рыбу или охотится на зверька, то есть рыбак или охотник. Однако эта гипотеза слабее, так как слово «зерак» в значении «рыба» очень редкое и локальное.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Подзеракина — это «жена Подзераки» или «дочь Подзераки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а, -я. Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в центральных и северных областях России, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение. Поскольку фамилия недворянская, предки Подзеракиных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, а прозвище закрепилось за родом из-за характерной черты первого носителя — зоркости, наблюдательности или склонности к надзору.