Фамилия Полонкий — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с географическим названием, но с одной важной оговоркой. Читатель, скорее всего, сразу подумает о городе Полоцке (одном из древнейших в Беларуси). Однако в фамилии пишется «н», а не «ц»: Полонкий, а не Полоцкий. Это не опечатка, а особенность словообразования.

Разберёмся. Фамилии на -ский обычно указывают на местность: откуда человек родом. Полоцк дал бы фамилию Полоцкий (с чередованием ц/к). Но на восточнославянских землях, особенно в украинской и белорусской среде, существовала модель, где топоним брался в форме родительного падежа множественного числа: «из Полонок» — то есть из села или усадьбы с названием Полонки, Полонка, Полонь. Суффикс -к- в основе — уменьшительный или указывающий на принадлежность к местности. Так появилась фамилия Полонкий — «тот, кто из Полонок».

Есть и вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование. В польском языке слово «polon» означает «поляк» (от «Polonia»). Фамилия могла возникнуть как указание на польское происхождение или на принадлежность к польской культуре (ср. Шляхетский, Панский). Но в этом случае ожидалось бы ударение на второй слог (Поло́нкий), а не на первый, как в географической версии. Поэтому основной и самой правдоподобной остаётся связь с конкретным селением Полонки.

География фамилии сегодня — преимущественно западные регионы России, Беларусь и восток Украины. Носителей мало, фамилия нечастотная. В дореволюционных списках она почти не встречается, что говорит о её позднем закреплении (вероятно, в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по месту жительства). Сословно — скорее всего, крестьянская или мещанская.

Таким образом, предок носителя фамилии Полонкий, скорее всего, был выходцем из небольшого поселения Полонки (или Полонь) и получил фамилию по месту своего происхождения. Ударение, судя по живой речи носителей, ставится на первый слог: По́лонкий.