Основой фамилии Полынская послужило мирское имя Полынь. Мирское имя Полынь может быть образовано от названия растения полынь. Давая младенцу такое имя, как Полынь, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это растение. Также нельзя исключать, что фамилия Полынская образована от названия села Полынь, Полынино или Полынское. Выходцем из этого села мог быть основатель рода Полынских. Населённые пункты с такими названиями могут встречаться в России повсеместно, а потому не представляется возможным указать, выходцем из какой именно местности был основатель рода Полынских. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Полынь, со временем получил фамилию Полынская.