Фамилия Помпеев — редкий случай, когда русская фамилия образована от имени, которое носил знаменитый римский полководец и политик I века до н. э. Гней Помпей Великий. На первый взгляд кажется, что перед нами книжная, «кабинетная» фамилия, которую мог получить семинарист или выходец из духовного сословия. И это самая вероятная версия: в семинарской среде было принято давать будущим священникам «благозвучные» фамилии по именам античных героев, философов или по названиям городов. Так наряду с Цезаревыми, Горациевыми и Вергилиевыми появились и Помпеевы.

Модель образования проста: к основе «Помпей» добавили типичный русский патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — Помпеев). В бытовой, нецерковной среде имя Помпей на Руси не встречалось — оно было чуждым для крестьянского именослова, где преобладали календарные имена. Поэтому фамилия Помпеев почти наверняка искусственного происхождения, а не от прозвища или мирского имени.

Впрочем, есть и другая, менее популярная гипотеза. В некоторых говорах слово «помпа» означало пышность, высокомерие, а «помпееватый» — важный, надутый человек. Теоретически прозвище Помпей могли дать за чванливый характер, и тогда фамилия возникла бы из прозвища, а не из античного имени. Но эта версия слабее: слишком узкая и редкая диалектная основа, а письменных подтверждений такому прозвищу в исторических документах почти нет. Гораздо логичнее предположить семинарское происхождение, тем более что фамилии на -ев от латинских и греческих имен в духовном сословии — явление массовое.

Географически Помпеевы встречаются разрозненно, без ярко выраженного гнезда. По переписям XIX — начала XX века единичные носители фиксировались в центральных губерниях и в Поволжье, что тоже косвенно подтверждает «семинарскую» версию: выпускники духовных училищ и семинарий разъезжались по разным епархиям. Фамилия так и осталась малочисленной, не превратившись в массовую крестьянскую или дворянскую.