Фамилия Попонов образована от прозвища, которое восходит к нарицательному «попона» - «одеяло, покрывало на лошадь». Попона предохраняла разгоряченную после работы лошадь от простуды. Скорее всего, прозвище Попона получил заводчик лошадей, либо заботливый пастух. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Попона, со временем получил фамилию Попонов.