Фамилия Порохненко образована от прозвища Порохня. Это украинское нарицательное слово многозначно, и в нём кроется сразу несколько возможных историй предков. Основных значений два: «трухлявое или гнилое дерево» и «порох». Первое значение указывает на быт: прозвище могли дать человеку, жившему у старого дупла или в ветхой избе, — такая деталь легко закреплялась за крестьянином. Второе значение отсылает к ремеслу: Порохней могли называть оружейника или пороховщика, чей труд был связан с опасным «зельем».

Существует и третья версия, более поэтичная. В старину слово «пороха» означало «пушной, рыхлый снег, идущий в безветрие». Такой снег ложится ровно и тихо, и родители могли назвать Порохней ребёнка, появившегося на свет в день первого снегопада. В этом случае прозвище превращалось в мирское имя, которое несло пожелание лёгкой, ровной судьбы.

Как именно прозвище закрепилось за конкретным человеком — через ремесло, место жительства или календарную примету — сейчас сказать трудно. Но модель образования фамилии прозрачна: суффикс -енко типичен для украинских фамилий и означает «сын, потомок такого-то». Порохненко — буквально «сын Порохни». Такая патронимическая форма в XVI–XVII веках массово вытесняла прозвища в официальных документах, особенно на Левобережной Украине и в Запорожье, где подобные фамилии на -енко встречались особенно часто.

Фамилия редкая, и это делает её ценной для генеалогии: чем меньше носителей, тем вероятнее, что все они — родня, и проследить общий корень проще. Сравните с однокоренными Порохов, Порохин, Порохня — все они тянутся к той же основе, но Порохненко сохранила украинский суффикс, выдающий южное происхождение рода.