Фамилия Поципун — редкий случай, когда основа слова не даёт однозначной подсказки, а суффикс указывает на географию. Конечное -ун характерно для западнорусских, украинских и белорусских земель: так образовывали прозвища от глаголов (крикун, ворчун, скакун). В данном случае основа «поцип-» — скорее всего, искажённое или диалектное «пощип-», то есть «щипать». Прозвище Поципун мог получить либо тот, кто щипал (например, птицу, лён, паклю), либо, в переносном смысле, человек придирчивый, «щиплющий» окружающих мелкими замечаниями.

Версия с украинским корнем «цип-» (цыплёнок, цыпа) тоже возможна, но менее вероятна: тогда фамилия звучала бы как Поципенко или Поципчук. Суффикс -ун указывает на активное действие, а не на предмет. Поэтому исходное прозвище было глагольным: «тот, кто щиплет» или «тот, кто пощипывает».

Фамилия не встречается в дворянских родословных книгах и не фиксируется в старых переписях центральной России. Её носители — скорее всего, крестьяне или ремесленники из западных губерний (Могилёвской, Витебской, Черниговской), где диалектное «поципать» (пощипать) было в ходу. В современной России фамилия крайне редка, что подтверждает её локальное происхождение.

С точки зрения словообразования, Поципун стоит в одном ряду с фамилиями вроде Дергун, Толкун, Свистун — все они образованы по одной модели от глаголов, обозначающих характерное действие. Разница лишь в том, что «поципать» не стало общеупотребительным литературным словом, а осталось в народной речи.