Фамилия Примататов — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а почти наверняка прозвище, данное «с перебором». Чтобы это понять, достаточно разобрать её по составу: корень «примат» плюс суффикс -ов, но с характерным наращением -ат-.

Слово «примат» в современном языке означает высшее млекопитающее (обезьяну), но в русских говорах и просторечии XIX века у него было другое, куда более хлёсткое значение. «Приматом» в народе называли человека, который важничает, корчит из себя значительную особу, ломается. Это не столько про глупость, сколько про манеру поведения: надутый, претенциозный тип, который «строит из себя примата» — то есть ведёт себя неестественно и напыщенно. Прозвище было язвительным, но не обязательно злым — скорее насмешливым.

Форма Примататов, а не Приматов, указывает на то, что прозвище, скорее всего, звучало как «Примататый» — то есть «тот, кто обладает качеством примата». Суффикс -ат- в русских фамилиях часто встречается в прилагательных, описывающих внешность или характер (горбатый, носатый, бородатый). В данном случае «примататый» — человек с повадками примата. А уже от этого прилагательного образовалась фамилия по стандартной патронимической модели: «чей сын?» — Примататов. Такой переход — от качественного прилагательного к фамилии — встречается нечасто и делает эту фамилию словообразовательно любопытной.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским регионам, где суффикс -ат- в прозвищах был более продуктивен, чем на севере. Встречается она крайне редко, в основном в единичных записях по Курской, Воронежской и Харьковской губерниям. Это позволяет предположить, что предок носителя фамилии был человеком заметным, с яркой манерой поведения — возможно, местным шутом, бойким торговцем или просто чудаком, которого запомнили именно за его «приматство».

В отличие от фамилий на -ов, образованных от церковных имён (Иванов, Петров), Примататов — пример чисто бытового, неофициального прозвища, которое закрепилось в документах случайно, но точно. Никакой связи с наукой о приматах или биологией здесь нет — только народная ирония и наблюдательность.