Фамилия Прохорко отвечает на вопрос «чей ты?» и образована напрямую от крестильного имени Прохор. Если переводить с греческого, имя это означает «начальник хора» или «руководитель хора» — от слов «про» (впереди) и «хорос» (хоровод, танец). В древнегреческой культуре такое имя давали не каждому: оно указывало на человека, который ведёт за собой других, задаёт ритм и порядок. Отсюда и пошло распространённое толкование, что предок-Прохорко был человеком заметным, с высоким социальным положением или, по крайней мере, уважением в общине.

Словообразовательная модель здесь типично украинская. Суффикс «-ко» в украинских фамилиях выполнял ту же роль, что и русские «-ов» или «-ин»: он превращал личное имя отца в имя его потомков. Буквально Прохорко — это «сын Прохора», «Прохоров». Такая форма широко бытовала в Поднепровье, на Левобережной Украине и в южных регионах, где уменьшительно-патронимические фамилии на «-ко» встречались сплошь и рядом. Со временем отчество застыло и стало передаваться уже как наследственная фамилия, не меняясь по поколениям.

Интересно, что в русской традиции тому же имени соответствуют фамилии Прохоров и Прохоренков, в белорусской — Прохорович, а в польской — Прохоркевич. Фамилия Прохорко сохранила наиболее краткую, архаичную форму, которая в старинных документах могла писаться и как Прохорко, и как Прохорок — с беглой гласной в конце. Оба варианта встречаются в метрических книгах XIX века, но современное написание закрепилось без «ок».

Крестильное имя Прохор вошло в православные святцы благодаря апостолу от семидесяти Прохору, одному из первых диаконов Иерусалимской церкви. На Руси и в Речи Посполитой имя было распространённым среди простых крестьян и казаков, так что носители фамилии Прохорко в большинстве своём происходят не из знати, а из свободных земледельцев или казачьей старшины. Социальный статус первых Прохорко, вопреки «руководящему» значению имени, определялся скорее не богатством, а тем, что родоначальник был уважаемым главой большой семьи.

Сегодня фамилия остаётся преимущественно украинской, хотя после переселений конца XIX — начала XX века её носители встречаются и в Сибири, и на Дальнем Востоке, и в странах с украинской диаспорой. В написании Прохорко нет двойных букв и сложных сочетаний, поэтому она легко читается и не искажалась при переписях, что помогает проследить родословную по архивным исповедным росписям и ревизским сказкам.