Фамилия Прохорская образована от мужского крестильного имени Прохор, которое в переводе с греческого означает «запевала, заводила» или «тот, кто водит хор». Это имя входило в святцы благодаря одному из семидесяти апостолов, диакону Прохору, поэтому было распространено на Руси среди всех сословий. Однако сама форма фамилии — с суффиксом -ск- — указывает на то, что её носители принадлежали не к крестьянскому, а скорее к высшему сословию: дворянству или духовенству.

Такие фамилии на -ский/-цкий первоначально возникали у польской шляхты и русского дворянства, а также у священнослужителей, которых часто записывали по названию церкви или прихода. В случае с фамилией Прохорская возможны две основные версии происхождения. Первая: предок получил фамилию по имени отца или деда, то есть был сыном Прохора, но в форме притяжательного прилагательного, что типично для знатных родов. Вторая: фамилия связана с географическим названием — селом или деревней Прохоровка (такие топонимы встречаются в разных регионах России, включая знаменитую Прохоровку на Белгородчине), откуда мог происходить основатель рода.

Словообразовательная модель здесь классическая для аристократических фамилий: к основе Прохор- добавляется суффикс -ск- и окончание -ая, что даёт форму, отвечающую на вопрос «чей?» или «из какого места?». В крестьянской среде чаще использовали краткие формы типа Прохоров или Прохоркин, поэтому именно окончание -ская выдаёт в носителях фамилии людей более высокого социального статуса. Впрочем, не стоит исключать и семинарский вариант: если предок учился в духовном училище, ему могли дать фамилию в честь святого Прохора — такие искусственные фамилии тоже нередко оформляли через -ский.

Однокоренные фамилии — Прохоров, Прохоренко, Прохорчук, Прохорец — встречаются чаще и у разных сословий, тогда как Прохорская остаётся более редкой и «камерной». Исторических документов, которые бы точно назвали первого известного носителя этой фамилии, в открытых источниках нет, поэтому о конкретных датах и именах говорить преждевременно. Можно лишь уверенно утверждать, что корень фамилии — древний, византийский, а сама форма — маркер принадлежности к образованному или привилегированному слою общества, что и делает её особенной среди прочих «прохоровских» фамилий.