Фамилия Пронищева — женская форма фамилии Пронищев, и её разбор стоит начать с мужского варианта, чтобы понять, откуда пошло имя. Основа здесь — «Пронищ-», а суффикс «-ев» указывает на принадлежность: буквально «сын Пронища». Само же прозвище Пронища — это характерная для старых русских говоров форма, образованная от имени Проня. Проня, в свою очередь, — это уменьшительная форма от канонического имени Прокопий (в народе часто звучало как Прокофий) или от Прохор. Такое стяжение и добавление суффикса «-ищ-» (с оттенком увеличительности или пренебрежения) давало прозвища вроде Пронища — то есть «большой Проня» или «эдакий Проня».

Словообразовательная модель с суффиксом «-ищ-» встречается в русских фамилиях нечасто, но она яркая. Если сравнить с однокоренными, то Пронищев стоит в одном ряду с фамилиями Пронин, Пронкин, Проняев, но выделяется именно этим «увеличительным» элементом. В документах XV–XVII веков прозвища на «-ища» фиксировались в северных и центральных уездах, особенно в новгородских и тверских землях, где любили такие экспрессивные формы. Это не официальное имя, а бытовое прозвище — скорее всего, так называли крупного, видного или просто заметного человека по имени Проня.

Географически фамилия Пронищев (и Пронищева) редкая. В современных базах данных она встречается точечно: несколько носителей зафиксировано в Тверской области, на Вологодчине и в Москве. Это подтверждает её северно-русское происхождение. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или посадской — такие прозвища редко давали дворянам, хотя в XVI веке встречаются упоминания Пронищевых среди служилых людей, например, в писцовых книгах. Но это единичные случаи.

Версия о происхождении от слова «проныра» (хитрый, ловкий человек) маловероятна. Фонетически «Пронища» и «проныра» расходятся: в корне «проныр-» нет мягкого «н» и суффикса «-ищ-». Это разные модели. Поэтому основная гипотеза — от имени Проня через прозвище Пронища — остаётся самой надёжной.