Фамилия Прруткина — редкий случай, когда написание само подсказывает путь к разгадке. Сдвоенная «р» в корне бросается в глаза: в русских фамилиях такое встречается нечасто и обычно указывает либо на иноязычное происхождение, либо на искажение при записи в документах. Скорее всего, перед нами вариант фамилии Пруткина или Прюткина, где двойная согласная возникла случайно — из-за нечёткого произношения или описки писаря.

Если отбросить лишнюю букву, основа проясняется: «Прутк-» восходит к слову «прут» — тонкая ветка, металлический стержень. В старину прозвище Прут или Пруток могли дать человеку высокому и худому, как хворостина, или, наоборот, неуступчивому, «колючему». Реже встречалась профессиональная версия: прутником называли мастера, который гнул или ковал прутья — например, для плетёных изделий или кузнечных работ.

Суффикс «-ин» в окончании указывает на притяжательный тип: Прруткина — это чья? — жена или дочь Пррутки (Прутка). В русской ономастике модель «-ин» характерна для фамилий, образованных от личных имён или прозвищ на -а/-я. То есть основа — мужское прозвище Прутка, а фамилия закрепилась за его потомками.

География фамилии практически не изучена. В современных базах данных Прруткина встречается единично, в основном в центральной России. Возможно, её носители — выходцы из одного села, где фамилия зафиксировалась в таком необычном написании. В словарях Б. Унбегауна или В. Никонова эта фамилия не упоминается, что подтверждает её редкость.

Итог прост: Прруткина — это, вероятнее всего, искажённая форма от Пруткина, образованная от прозвища Прутка по внешности или ремеслу. Двойная «р» — не смысловая, а графическая случайность, которая, впрочем, и делает фамилию уникальной.