Фамилия Прудовикова — женская форма фамилии Прудовиков. Она образована от слова «пруд» с помощью суффикса -овик, что сразу отличает её от более распространённых «прудовских» и «прудовых». Суффикс -овик в русских фамилиях встречается редко и обычно указывает на род занятий или характерную примету человека: ср. Садовников, Мельников, Дворников. Прудовиков — буквально «тот, кто при пруде» или «прудовой работник». Владелец пруда, смотритель, рыбак или человек, живший у пруда, — вот круг возможных значений прозвища, которое легло в основу фамилии.

По модели образования Прудовиков стоит в одном ряду с фамилиями на -иков, которые нередко возникали от названий профессий с тем же суффиксом: Сапожников, Скорняков. Однако в отличие от них основа Прудов- не указывает на ремесло напрямую. Более вероятно, что прозвище Прудовик дали человеку по месту жительства или по хозяйственной привязке к конкретному пруду — например, крестьянину, чей надел примыкал к пруду, или тому, кто арендовал пруд для разведения рыбы. В центральных губерниях России, где пруды играли важную роль в деревенском укладе (водопой, полив, рыболовство), такие прозвища были естественны.

Фамилия Прудовикова — относительно редкая. Согласно данным переписей и телефонных справочников, основные очаги бытования — Тверская, Ярославская и Московская области. Встречается она и на Урале, куда могла попасть с переселенцами из центра. В написании встречается вариант Прудова (от Пруд), но Прудовиков — более старая, архаичная форма, сохранившая полный суффикс прозвища. С точки зрения социальной истории, носители фамилии почти наверняка относились к крестьянскому сословию: дворянские фамилии на -овиков практически не образуются, а купеческие и мещанские чаще имели суффикс -ов.

Если разбирать фамилию по составу: корень пруд-, суффикс -овик (указывает на лицо, связанное с предметом), окончание -а (женский род). Мужская форма — Прудовиков. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Прудовикова, хотя в диалектах возможен вариант на третий слог. Никакой связи с малахитовой улиткой прудовиком (Lymnaea stagnalis) здесь нет: прозвище появилось задолго до того, как зоологи дали моллюску такое название. Фамилия — прямой потомок деревенского быта, где пруд был не декоративным, а рабочим местом.