Фамилия Пуняков образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Пуняков, скорее всего, произошла от прозвища Пуняк. Пуней у восточных славян называется сарай для хранения сена, а также чулан для всякой всячины, где иногда спит хозяин, а также хлев. Возможно, прозвище Пуняк указывает на место, где предок жил или проводил много времени. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пуняк, со временем получил фамилию Пуняков. О точном месте и времени возникновения фамилии Пуняков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Пуняков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.