Фамилия Пустовойтовский — яркий пример того, как географическая привязка, закрепившись в прозвище, со временем превратилась в дворянскую фамилию с характерным польско-украинским суффиксом. Ключевой элемент здесь — окончание -ский, которое в восточнославянской ономастике (особенно в Речи Посполитой) указывало на принадлежность к месту или владению им. Это не просто «сын такого-то», а скорее «тот, кто из такого-то места» или «владелец такого-то поместья».

Основа фамилии — прозвище Пустовойт. Оно составное: «пустой» (в значении «незанятый», «порожний», а не «глупый») и «войт» (выборное должностное лицо в сельской общине, аналог старосты или судьи в украинских и белорусских землях). Таким образом, Пустовойт — это либо человек, который временно исполнял обязанности войта («пустое» место войта, пока не выберут постоянного), либо, что вероятнее, прозвище ироничное: «пустой войт» — начальник без реальной власти, формальная фигура. Встречается также версия, что так могли назвать человека, жившего на месте, где раньше был войт, но должность упразднили.

Фамилия Пустовойтовский, скорее всего, образовалась от названия хутора или деревни Пустовойтовка (или Пустовойтово), владельцем или выходцем из которой был предок. Такие топонимы нередки на территории современных Украины и Беларуси. Суффикс -ов- соединяет основу прозвища с типичным для шляхетских фамилий окончанием -ский. Это указывает на то, что носитель фамилии мог принадлежать к мелкопоместной шляхте или казацкой старшине, которая в XVIII–XIX веках оформляла своё дворянство, привязываясь к родовому гнезду.

В отличие от простых крестьянских фамилий на -ов/-ев, форма на -ский была маркером более высокого социального статуса. Поэтому, хотя корень «пустой» звучит неблагородно, вся конструкция «Пустовойтовский» — это попытка облагородить прозвище, превратив его в фамилию помещика. Встречаются и однокоренные варианты — Пустовойт, Пустовойтенко, Пустовойтов — но именно форма на -ский выдает сознательное стремление к «шляхетности». В современных телефонных справочниках фамилия встречается крайне редко, что подтверждает её узколокальное происхождение, скорее всего, из Волынской, Киевской или Подольской губерний.