В основе прозвища Пустовойт лежит нарицательное «войт», т.е. «сельский староста в западных районах». Скорее всего, это прозвище получил староста, владения которого были опустошены пожаром, голодом, эпидемией. Прозвище могло носить и оценочный характер: в этом случае односельчане, скорее всего, были недовольны своим старостой. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пустовойт, со временем получил фамилию Пустовойтов.