Фамилия Путане — редкая для русской ономастики, и её происхождение почти наверняка не связано с русским языком. В славянской среде фамилия с окончанием «-е» нетипична: стандартные русские фамилии оформляются суффиксами -ов/-ев, -ин, -ский или, реже, застывшими формами вроде -их/-ых. Окончание «-е» и ударение, скорее всего, на последнем слоге (Путанé) указывают на иную языковую среду.

Наиболее вероятная версия — латышское или литовское происхождение. В латышском языке слово putns означает «птица», а putane — «птичка» (уменьшительно-ласкательная форма). Фамилия Путане (Putāne) в Латвии действительно существует и встречается, особенно в восточных регионах. Она могла образоваться как прозвище человека, чем-то напоминавшего птицу (лёгкостью, пением, повадками), либо как указание на место, где водилось много дичи. В литовском языке есть близкое слово puta («пена»), но оно даёт фамилию Путайтис или Путавичюс, а не Путане.

Вторая версия, менее вероятная для русской фамилии, — финский корень. В финском putaan означает «чищу, расчищаю» (от глагола putata). В этом случае фамилия могла бы принадлежать человеку, занимавшемуся расчисткой леса под пашню, но такая фамилия в Финляндии не является распространённой.

Третья, спекулятивная версия пытается связать фамилию с русским глаголом «путать». Однако слово «путане» не является ни прозвищем, ни диалектным вариантом в русском языке. Такое слово не фиксируется в исторических источниках как личное имя или прозвище. Если бы фамилия была русской, она звучала бы как Путанов, Путанин или Путаев.

Таким образом, с высокой долей уверенности можно утверждать: фамилия Путане — балтская, скорее всего латышская. Если предки носителя фамилии жили на территории бывшей Российской империи, они могли быть латышами или латгальцами, переселившимися в другие губернии. В документах XIX века фамилия могла записываться через «а» (Путане) или с окончанием «-с» (Путанес) при русификации.