Фамилия Рафаюк — наглядный пример того, как украинская словообразовательная модель превратила личное имя в фамилию. Её основа — крестильное имя Рафаил, которое пришло из древнееврейского языка и означает «Бог исцелил» или «исцеление Божие». В православных святцах это имя носит один из архангелов, что обеспечило ему популярность в народе, хотя в быту оно часто сокращалось до форм Рафай, Рафа, Раф.

Ключевая деталь — суффикс -юк, один из самых распространённых на западе Украины, особенно на Волыни, Подолье и в Галиции. Он указывал на принадлежность: Рафаюк — буквально «сын Рафая» или «потомок Рафаила». Такая модель типична для украинских фамилий, образованных от имён или прозвищ, и аналогична русским фамилиям на -ов, но с другим оттенком — скорее родственным, чем владельческим.

В отличие от фамилий вроде Рафаилов, которые встречаются в русской среде, Рафаюк чётко локализуется в западноукраинском ареале. Носители фамилии могли быть крестьянами, мещанами или казаками — суффикс -юк не даёт сословной привязки, он просто фиксирует, что предка звали Рафаил. Встречаются и варианты написания: Рафайюк, Рафаюк с ударением на последний слог, что характерно для говоров Волыни.

Споров о происхождении немного: версия с именем Рафаил — единственная состоятельная. Редкая гипотеза о связи с польским словом «rafa» (риф) или тюркским «рафат» (роскошь) не выдерживает критики — ни фонетически, ни географически к фамилии она не применима. Таким образом, Рафаюк — типичная украинская фамилия-патроним, которая сохранила в себе память о предке с библейским именем, и её носители в основном сосредоточены в западных областях Украины.