Фамилия Раин — редкий случай, когда напрашивающаяся версия оказывается не главной. На слух она звучит как типичная «именная» фамилия на -ин: мол, был человек с именем или прозвищем Рая, и его дети стали Раины. Но загвоздка в том, что полное имя Рая — мужское и крайне редкое. В святцах есть Рая (Раий), но в крестьянской среде это имя почти не встречалось. Поэтому версия с женским именем Рая (от Раиса) тоже слаба: фамилии от женских имён давали редко и обычно вдовьим или незаконнорождённым детям, что не объяснило бы массовость.

Куда убедительнее версия от прозвища, связанного с диалектным словом «рай» или «раина». В южнорусских и украинских говорах «раина», «рай-дерево» — это народное название некоторых деревьев (чаще всего ивы или рябины), а также кустарника. Человек мог получить прозвище Раина за высокий рост, плакучий нрав или за то, что жил у заметного дерева. Суффикс -ин в таком случае указывает на принадлежность: «сын Раины». Это объясняет и то, почему фамилия встречается не только у великороссов, но и у украинцев — в форме Раїн или Райн.

Вторая версия, тоже без «воды»: Раин — это стяжённая форма от фамилии Рахин, где звук «х» выпал для благозвучия. Рахин, в свою очередь, восходит к уменьшительному Раха от канонического имени Рафаил (в просторечии — Рахвил). Такое стяжение — не редкость в русской ономастике (сравните: Махин — Маин). Но эта цепочка сложнее, и для фамилии Раин она менее типична, чем «растительная» версия.

Географически фамилия привязана к югу России и востоку Украины: Слобожанщина, Дон, Курская и Воронежская губернии. Там слово «раина» было в ходу, и там же фамилия фиксируется в метрических книгах XIX века. В северных и центральных губерниях она встречается редко и, скорее всего, занесена переселенцами.

Таким образом, предки современных Раиных — скорее всего, не потомки некой Раи, а люди, которых в деревне прозвали за сходство с деревом или за место жительства. Фамилия — из тех, что хранят местный говор и природные реалии, а не церковные имена.