Фамилия Ратушкина — женская форма фамилии Ратушкин, а та образована от прозвища или мирского имени Ратушка. В русской ономастике это редкий случай, когда основа фамилии не очевидна на первый взгляд, и её разбор требует обращения к диалектной лексике.

Корень «ратуш-» напрямую связан со словом «ратуша» — здание городского самоуправления, магистрат. Однако маловероятно, что предок носителя фамилии был буквально ратушей. Скорее всего, прозвище Ратушка дали человеку, который работал при ратуше: писарю, глашатаю, сторожу или сборщику податей. В некоторых говорах «ратушкой» могли называть бойкого, шумного человека, который «ратует» — громко говорит, спорит или заступается за других. Есть и версия, что это уменьшительная форма от редкого канонического имени Ратмир (славянское по происхождению, означающее «ратующий за мир»), но она менее убедительна, так как имя Ратмир не было широко распространено в крестьянской среде.

С точки зрения словообразования, суффикс -ин указывает на принадлежность: Ратушкин — сын или потомок Ратушки. Фамилия закрепилась в центральных и южнорусских областях, где институт ратуш был более развит (например, в Малороссии и на юге России ратуши существовали в городах и крупных сёлах). Встречается она нечасто, что косвенно подтверждает её профессиональное, а не массовое происхождение: не каждый крестьянин имел отношение к городскому управлению.

Таким образом, предок Ратушкиных, скорее всего, был человеком «при должности» — служащим местной администрации, писарем или глашатаем, а может, просто обладал громким голосом и характером заступника.