Основой фамилии Ротанина послужило мирское имя Ротан. Фамилия Ротанина восходит к нарицательному «ротан» - «рыба отряда окунеобразных». Видимо, от названия этой рыбы было образовано нецерковное имя, от которого и произошла фамилия. Такие «рыбные» имена были популярны у славян в дохристианскую эпоху. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ротан, со временем получил фамилию Ротанина.