Фамилия Руканова — женская форма фамилии Руканов, а та образована от прозвища или нецерковного имени Рукан. Как и многие русские фамилии на -ов, она закрепилась в XVI–XVII веках, когда крестьян и посадских людей начали массово записывать «по отцу»: чей сын? — Руканов. Соответственно, Руканова — «дочь (или жена) Руканова».

Слово «рукан» в старых говорах не было общеупотребительным, но его можно связать с несколькими реальными значениями. В северных и сибирских диалектах «руканом» называли рукав реки, протоку, а также изгиб русла. Человек мог получить такое прозвище, если жил на излучине или владел землёй у рукава реки. Второй вариант — «рукан» как «тот, кто делает что-то руками», то есть мастер, ремесленник. В псковских и тверских говорах «руканить» означало «работать руками», «мастерить». Третья, менее очевидная версия — от древнерусского имени Рукан, которое могло быть прозвищным, от слова «рука» (сильная рука, правша).

Интересно, что фамилия Руканов встречается в основном в северных и центральных областях России — в Архангельской, Вологодской, Костромской, а также на Урале. Это указывает на то, что носители фамилии были, скорее всего, выходцами из крестьянской или ремесленной среды. В дворянских родословных книгах Рукановы не значатся — фамилия осталась в простонародье.

С точки зрения словообразования здесь необычен суффикс -ан, который в русских фамилиях встречается реже, чем -ак или -ун. Он придаёт основе оттенок принадлежности или характерного признака: ср. Горлан (горластый), Долган (долговязый), Шишан (от «шиш» — острый). Рукан, вероятно, — «рукастый», умелый или живущий у речного рукава.

Если ваши предки носили фамилию Руканова, ищите их в переписях северных уездов или в метрических книгах старообрядческих общин — на Русском Севере фамилия сохранилась лучше всего.