Фамилия Руньковский — это типичная «географическая» фамилия, образованная от названия места, где жил основатель рода. Вопреки распространённому мнению, она не связана напрямую с прозвищем Руньков, а восходит к названию населённого пункта вроде Руньково или Руньковичи. Такие деревни встречались по всей территории бывшей Речи Посполитой и Российской империи — от Смоленщины до Волыни. Человек, переехавший из такой деревни в город или другое село, получал прозвище Руньковский, то есть «тот, кто из Рунькова».

Сам топоним Руньково, скорее всего, связан с общеславянским словом «руно» — овечья шерсть. В старину руном называли не только шерсть, но и густую траву, а также «рунную» землю — плодородную, дающую хороший урожай. Поэтому название деревни могло указывать либо на занятие жителей овцеводством, либо на качество местных пастбищ. Впрочем, не исключено и личное имя Рунька — уменьшительная форма от Родион или Роман. В этом случае фамилия означала бы «сын Руньки».

Суффикс -ский в фамилии — верный признак дворянского или шляхетского происхождения. В Польше и Литве фамилии с таким окончанием носили в основном представители шляхты, владевшие землёй. После разделов Речи Посполитой часть шляхты обеднела и перешла в однодворцы или мещане, но фамилия сохранила память о сословных корнях. Именно поэтому среди носителей фамилии Руньковский так много людей с польскими или белорусскими корнями.

В русских документах фамилия встречается с XVII века, когда выходцы из западных земель поступали на службу к московским царям. Позже, в XIX веке, семинаристы часто меняли свои бытовые фамилии на более благозвучные с суффиксом -ский, но в случае с Руньковскими такое маловероятно — слишком конкретная географическая привязка.

Сегодня фамилия Руньковский встречается нечасто, но её носители живут в России, Украине, Беларуси и Польше. В каждом регионе написание может слегка отличаться: Руньковский, Рунковский, Рунькевич. Но основа одна — память о небольшом поселении, где когда-то жил предок, занимавшийся то ли овцеводством, то ли земледелием на плодородных «рунных» землях.