Фамилия Рунько чаще всего звучит в украинской и южнорусской среде, и её происхождение напрямую связано с прозвищем Рунь. Сразу отбросим ложный след: к слову «руно» (овечья шерсть) фамилия отношения не имеет, как и к рунам. Основа здесь — украинское слово «рунь», которым называют молодую густую листву, буйную зелень, первые всходы озимых. Человек, получивший такое прозвище, либо жил среди пышной растительности, либо сам был под стать зелени — крепким, быстро растущим, живым.

Интересна и словообразовательная модель. Формант -ко в украинской традиции — это типичный уменьшительно-ласкательный или «сыновний» суффикс. То есть Рунько — это буквально «маленький Рунь» или «сын Руня». Такой способ образования характерен для западнорусских и украинских земель, где фамилии на -ко, -енко, -ук встречаются повсеместно. При этом прозвище Рунь, от которого всё пошло, могло быть и самостоятельным, и производным от других имён, но именно растительная версия выглядит самой убедительной.

Любопытная деталь: от того же прозвища позже образовалась фамилия Руньковский. Это уже более поздняя, полонизированная или «шляхетская» форма, которая добавляла к основе суффикс -овский, чтобы звучать благороднее. Наличие двух родственных фамилий — Рунько и Руньковский — показывает, что носители одного прозвища в разное время и в разных социальных условиях оформляли его по-разному: кто-то остался с простым крестьянским Рунько, а кто-то, переезжая или получая документы, «улучшал» фамилию до Руньковского.

В документах прозвище Рунь, изначально присоединённое к наследственному имени, со временем полностью заменило его — и в повседневной жизни, и в официальных бумагах. Так потомки человека, которого когда-то прозвали за связь с зеленью или за бойкий нрав, стали просто Рунько. Фамилия нередкая для Черниговщины, Полтавщины и соседних областей, где слово «рунь» до сих пор живо в народной речи.