Фамилия Рыбачкина — женская форма фамилии Рыбачкин, которая относится к так называемым «профессиональным» фамилиям. В её основе лежит слово «рыбачка» — женщина, занимающаяся рыбной ловлей, либо жена рыбака. В русской ономастике это довольно редкий случай, когда прозвище образовано от женского рода занятия, а не от мужского. Обычно фамилии строятся по модели «рыбак → Рыбаков», но здесь мы видим суффикс -к- и окончание -а, что указывает на прямое прозвище женщины. Такое могло возникнуть в среде, где женский промысел был заметен — например, в северных или приозёрных деревнях, где женщины наравне с мужчинами участвовали в ловле рыбы или торговали уловом.

Словообразовательная модель Рыбачкин (-ин) типична для русских фамилий: суффикс -ин присоединялся к основам на -а/-я, обозначая принадлежность. То есть Рыбачкин буквально значит «сын (или потомок) Рыбачки». Важно не путать её с фамилией Рыбачкин, которая могла образоваться от украинского или белорусского варианта слова «рыбачка» (с ударением на второй слог). В русской традиции ударение, скорее всего, падало на первый слог: Ры́бачкина.

Географически фамилия встречается спорадически, без ярко выраженного ареала. В дореволюционных переписях она могла фиксироваться в формах Рыбачкинъ или Рыбачкина, причём в женском роде — если записывали вдову или хозяйку дома. Поскольку фамилия недворянская, её носители относились к крестьянскому или мещанскому сословию. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные примеры (типа Рыбачкин) не выделены отдельно, но модель с женской основой описана как редкая.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Рыбаков, Рыбкин, Рыбалкин, — то Рыбачкина стоит особняком: она не отвлечённо указывает на занятие, а называет конкретную женщину, чей труд или положение в семье стали родовым именем. Это может говорить о том, что в роду была сильная женская фигура — кормилица или хозяйка, чьё прозвище закрепилось за детьми.