Фамилия Саитдинов — яркий пример того, как русская модель фамилии на -ов накладывается на имя из тюркского или арабо-мусульманского мира. Основа здесь — мужское имя Саитдин, которое в свою очередь восходит к арабскому Саад ад-Дин (سعد الدين), что переводится как «счастье веры» или «благоденствие религии». Это составное теофорное имя, где вторая часть (дин — «вера, религия») указывает на связь с исламом.

Типичный для русского языка фамильный суффикс -ов (в форме Саитдин-ов) говорит о том, что фамилию дали по отцу: «сын Саитдина». В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имена с корнем «дин» (Гайнутдин, Хисамутдин, Саитдин) были очень распространены, поэтому искать корни фамилии Саитдинов стоит прежде всего в среде волго-уральских татар или башкир. Советская паспортизация 1920–1930-х годов закрепила за многими носителями таких имён именно русское окончание -ов, а не, скажем, татарское -ов/ев или башкирское -ов.

Интересно, что в самой основе есть редкий для славянской ономастики элемент — имя с двумя корнями. В то время как русские фамилии обычно строятся от прозвищ или календарных имён (Иванов, Петров), Саитдинов напрямую несёт значение религиозного благочестия. Предок носителя фамилии, скорее всего, был не просто крестьянином или ремесленником, а человеком, чьё имя подчёркивало его веру. Встречаются варианты написания Саитдинов и Саитдинов, но первый — основной.

Среди однокоренных фамилий — Саитов (от имени Саит), Саитовский, а также более редкие Саитдиновы, которые могли писаться через дефис или с иным окончанием. Географически фамилия чаще всего фиксируется в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях, где исторически велика доля татарского и башкирского населения.