Фамилия Сахенко образована по одной из самых распространённых восточнославянских моделей — с помощью суффикса -енко, который традиционно указывает на происхождение от отца или предка по имени. В украинской и южнорусской ономастике суффикс -енко (а также -ко) означал «сын» или «потомок». Поэтому Сахенко — это буквально «сын Саха» или «потомок Саха». Но кто такой Сах?

Основа фамилии восходит к личному имени Сах, которое является краткой или просторечной формой от канонического имени Исаакий. Исаакий — древнееврейское имя, означающее «он будет смеяться» (связано с библейским сюжетом о смехе Сарры). В народной украинской и белорусской традиции полные церковные имена часто сокращали до односложных форм: Исаакий превращался в Сахо, Сах. Со временем это прозвище или домашнее имя закрепилось за родом, и прибавление суффикса -енко дало фамилию Сахенко.

Вторая, менее вероятная, версия связывает фамилию с прозвищем Сах, которое могло произойти от глагола «сахать» (в диалектах — пахать, копать) или от слова «саха» (так в некоторых говорах называли мешок, куль). Однако в таком случае прозвище носило бы скорее бытовой, чем именной характер, и фамилий с основой Сах- (Сахно, Сахаров) больше, чем тех, что связаны с пахотой. Поэтому версия с именем Исаакий представляется основной и подтверждается типовой моделью украинских фамилий на -енко.

Географически фамилия Сахенко встречается преимущественно на востоке и юге Украины, а также в приграничных областях России (Белгородская, Курская, Воронежская). Это типичная фамилия крестьянского и казачьего сословия, которая фиксируется в ревизских сказках и метрических книгах XIX века. Сословного барьера она не имела: Сахенко могли быть как казаками, так и мещанами или государственными крестьянами.

В написании фамилии встречаются варианты: Сахенко, Сахенко (с ударением на первый или второй слог), а также Сахно (параллельная форма с суффиксом -но). Сравните с однокоренными фамилиями: Сахненко, Сахаров, Сахнюк. Все они восходят к той же основе Сах, но с разными суффиксами, что отражает региональные особенности словообразования.