Фамилия Самолкин — из тех, что хранят в себе память о личном имени предка, причём в его неофициальной, обиходной форме. В основе лежит имя Самолка, которое звучало как уменьшительно-ласкательный или просто разговорный вариант имени Самойло. А вот Самойло, в свою очередь, — народная, бытовая форма древнееврейского имени Самуил, означающего «услышанный богом». То есть буквально фамилию можно расшифровать как «сын Самолки», потомок человека, которого в кругу семьи и соседей звали именно так.

Вплоть до конца XIX века имя Самойло пользовалось заметной популярностью и в русских, и в украинских землях, что и объясняет появление целого гнезда родственных фамилий. Модель образования здесь классическая для восточнославянской традиции: суффикс -ин присоединялся к основе, оканчивающейся на согласный или -а, и указывал на принадлежность «чей сын», «чьих ты будешь». Так Самолка превратился в Самолкина — сначала так могли сказать про ребёнка или домочадца, а затем это закрепилось как родовое прозвание.

Интересно, что сама форма Самолка — не просто сокращение, а живой продукт народной этимологии. Имя перекраивалось на русский лад, подгонялось под привычное звучание, и в результате получило вид, который легко спутать с прозвищем. Однако в отличие от прозвищ, образованных от черт характера или ремесла, здесь мы имеем дело именно с переосмысленным каноническим именем. Поэтому версия о происхождении от Самуила выглядит наиболее убедительной и единственной, не требующей натяжек.

Стоит заметить, что фамилия Самолкин не слишком распространена, что типично для отчеств, образованных от редких разговорных форм. В документах XIX века носители фамилии встречаются преимущественно в центральных и южных губерниях России, где имя Самойло звучало чаще всего. Со временем связь с первоисточником стёрлась, и фамилия зажила самостоятельной жизнью, но её носитель всегда может проследить свою родословную до библейского пророка Самуила, чьё имя в переводе с иврита звучит как «услышанный богом».