Фамилия Саможина — женская форма, мужской вариант — Саможин. Это одна из тех русских фамилий, где суффикс -ин указывает на происхождение от имени или прозвища матери или отца: «чей?» — Саможин, то есть сын или дочь Саможи. Но что такое «Саможа»?

В основе лежит редкое прозвище или неканоническое имя Саможа. Самое прямое объяснение — от глагола «сам» и «жить» или «можа» (от «мочь»). В народной речи «саможить» могло означать «жить своим умом, самостоятельно», а «самомочь» — способность обходиться без чужой помощи. Так могли прозвать независимого, крепкого хозяина, который не кланялся сильным мира сего. В северных и сибирских говорах слово «саможила» встречалось как прозвище для одинокого, замкнутого человека, живущего бобылём.

Менее вероятная, но возможная версия — от диалектного «сам» + «ожа» (ср. «ожог» или «ожать»). В таком случае прозвище могло относиться к человеку, который «сам себя жжёт» — то есть торопливый, вспыльчивый, или, напротив, тот, кто много работает до изнеможения. Однако эта гипотеза слабее, так как не подкрепляется устойчивыми фольклорными или словарными примерами.

По модели образования фамилия Саможина стоит в одном ряду с такими как Художина, Доброжина, Миложина — все они образованы от прозвищ, состоящих из двух корней (само- и -жи-). Суффикс -ин здесь не уменьшительный, а притяжательный, что типично для русских фамилий XVI–XVII веков. Географически фамилия встречается редко, но чаще всего в центральных областях России — в Тверской, Ярославской и Костромской губерниях, где были распространены «самостоятельные» прозвища, отражающие характер или образ жизни человека.

Таким образом, Саможина — фамилия, которая скорее всего говорит о предке-индивидуалисте: либо о крестьянине, который жил своим двором без общины, либо о ремесленнике, работавшем в одиночку.