Фамилия Самута — редкий случай, когда географический разбор даёт больше, чем морфологический. На слух она звучит по-русски: суффикс -ут- встречается в старых русских прозвищах (например, Косой — Косут, Хромой — Хромута). Но в русской ономастике фамилии на -ута чаще всего украинские или белорусские, а в самой фамилии Самута корень «сам-» наводит на мысль о прозвище «Самута» — возможно, так называли человека, который сам себе на уме, своенравного или замкнутого. Однако это лишь первая версия, и не самая сильная.

Куда интереснее посмотреть на фамилию Самута в контексте западных говоров. В польском, белорусском и украинском языках слово «сам» часто давало уменьшительные формы с суффиксом -ута, но не в значении «одинокий», а как обозначение младшего или подчинённого — что-то вроде «самый маленький» или «сам по себе». Встречается и вариант, что фамилия могла образоваться от имени Самуил через усечение — Самута как Самуил + -та, но это спорно: для русского уха такое сокращение неестественно, а для польского — вполне.

Есть и третья, региональная гипотеза. В польском языке «samuta» (или «samot») — диалектное слово, означающее «одиночка» или «отшельник». В некоторых районах Беларуси и Подляшья фамилия Самута встречается именно среди потомков крестьян, которых так прозвали за нелюдимость или за то, что жили отдельным хутором. Если смотреть по современной географии, фамилия Самута чаще всего фиксируется в западной Беларуси и на юго-востоке Польши — это подтверждает скорее польско-белорусское происхождение, чем русское.

Таким образом, наиболее вероятная версия: фамилия Самута — прозвище, данное человеку за характер или образ жизни (одиночка, нелюдим), и закрепившееся в западных славянских говорах. Русский вариант с суффиксом -ута не исключён, но менее типичен для такой формы.