Фамилия Санаксыров — одна из тех, где разбор наталкивается на глухую стену: ни в одном из доступных ономастических словарей она не зафиксирована, а её основа не даёт очевидной отсылки к русскому или тюркскому корню. В таких случаях приходится работать с моделью образования и географией.

Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ов указывает на русскую патронимическую фамилию, то есть «чей?» — сын Санаксыра. Значит, в основе лежало личное имя или прозвище Санаксыр. Сама основа не похожа на славянскую: в ней нет корней, типичных для русских прозвищ (типа «сан» — сани, «сыр» — продукт). Скорее всего, перед нами тюркский или арабо-тюркский антропоним.

Самая правдоподобная версия — составное имя из двух частей. Первая часть «сан» в тюркских языках может означать «число», «почет», «слава» (ср. татарское «сан» — почёт, уважение). Вторая часть — «аксыр» или «аксырык» — менее прозрачна. Можно предположить, что это искажённое «ак сыр» — «белая тайна» или «белый предел» (от тюркского «ак» — белый, «сыр» — граница, тайна). Но это лишь гипотеза. Другой вариант: «Санаксыр» могло быть прозвищем человека, который занимался подсчётом или учётом (от «санак» — счёт, подсчёт в татарском). Тогда «Санаксыр» — «счётчик», «учётчик».

Фамилия крайне редкая. Поиск по открытым базам показывает единичные случаи, в основном в Поволжье — в Татарстане и соседних областях. Это косвенно подтверждает тюркские корни основы. Сословно, скорее всего, предки были крестьянами или мещанами из татарской или мишарской среды, которые получили фамилию при переходе на русскую систему именования в XIX веке.

Если верить гипотезе о прозвище «счётчик», то родоначальник мог быть сборщиком податей, писарем или человеком, который вёл учёт скота или зерна в сельской общине. Но это реконструкция, а не факт. Для точного ответа нужны архивные записи по конкретной семье.