Фамилия Санакоев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Санакоев уходит в XV-XVII вв. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Санакоев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Фамилия Санакоев имеет осетинское происхождение и восходит к мужскому имени Санак. Оно, в свою очередь, является вариантом имени героя нартского эпоса — Сайнаг. Это имя представляет собой трансформацию титула хана Батыя – Саин-хан («славный хан»). Само же имя Сайнаг переводится на русский язык как «князь Черной скалы». Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Санакоев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Тем не менее, фамилия Санакоев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.