Фамилия Санакова — женская форма фамилии Санаков. В русской традиции такие фамилии образуются с помощью суффикса -а, указывающего на принадлежность к роду: Санакова — жена или дочь Санакова. Основа фамилии, Санак-, восходит к прозвищу или личному имени, которое, скорее всего, имеет тюркское происхождение.

Корень «санак» в тюркских языках означает «счёт, число, подсчёт», а также «почёт, уважение». Прозвище Санак могли дать человеку грамотному, умеющему считать, или тому, кто занимался учётом — например, сборщику податей или переписчику. В некоторых диалектах «санак» означало «смышлёный, сообразительный», что тоже могло стать основой для прозвища. Менее вероятна, но возможна связь с арабским «сана» — «блеск, сияние», но в фамилии эта версия выглядит натянутой, так как слово «санак» в таком значении не зафиксировано в ономастических источниках.

Фамилия Санаков (и Санакова) встречается преимущественно у народов Северного Кавказа — осетин, ингушей, чеченцев, а также у балкарцев и кумыков. В осетинских фамилиях суффикс -ов часто указывает на русскую адаптацию местных родовых имён. Таким образом, предки Санаковых могли быть осетинами, принявшими фамилию по русскому образцу в XIX веке при документальном оформлении.

Интересная деталь: в осетинском языке есть слово «санаг» — «вино», и некоторые исследователи допускают, что фамилия могла возникнуть от прозвища винодела или торговца вином. Однако это лишь гипотеза, не подкреплённая широкой географией бытования фамилии. Основная масса носителей сосредоточена в Республике Северная Осетия — Алания, что делает осетинскую версию наиболее правдоподобной.

Сравните с однокоренными фамилиями: Санакоев (осетинская форма), Санаковский (польская или украинская адаптация). Разница в суффиксах говорит о разных путях формирования: -ов — типично русский, -оев — осетинский, -овский — западнославянский. Фамилия Санакова, таким образом, — это русская по форме, но тюрко-осетинская по корню фамилия, указывающая на род занятий или личное качество предка, скорее всего, связанного с учётом или умственным трудом.