Фамилия Санакин образована от прозвища Санака. Оно ведет свое начало от нарицательного «санник» - «мастер, изготовляющий сани». Соответственно, прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род деятельностт основателя фамилии. Возможно также, что прозвище образовано от топонима Санак — остров в составе Лисьих островов группы Алеутских островов. Не исключено, что предок Санакиных родился или жил на этом острове. Согласно еще одной, менее правдоподобной гипотезе, фамилия восходит к мужскому осетинскому имени Санак. Оно, в свою очередь, является вариантом имени героя нартского эпоса — Сайнаг. Это имя представляет собой трансформацию титула хана Батыя – Саин-хан («славный хан»). Само же имя Сайнаг переводится на русский язык как «князь Черной скалы». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Санака, со временем получил фамилию Санакин.