Фамилия Саннэ — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но происхождение при этом совсем не очевидно. С первого взгляда она кажется иноязычной: сочетание «нн» и окончание «э» нехарактерны для исконно русских фамилий, которые обычно заканчиваются на -ов, -ин или -ский. Однако, если присмотреться, перед нами классическая русская модель, просто записанная по фонетическому принципу.

Скорее всего, фамилия Саннэ — это вариант фамилии Санный, Саннов или Саннёв, зафиксированный в документах «на слух». В русских говорах, особенно северных и сибирских, окончание -ой в прилагательных и фамилиях часто редуцировалось в -ый, а в безударном положении звучало как нечто среднее между «ы» и «э». Писарь, записывая крестьянина или мещанина, мог передать звучание фамилии как «Саннэ» вместо «Санный». В основе лежит слово «сани» — распространённое транспортное средство на Руси. Фамилию могли дать человеку, который делал сани, торговал ими или, по прозвищу, постоянно ездил на санях. В ономастике такой переход от названия предмета к прозвищу, а затем к фамилии — рядовое явление.

Менее вероятна, но возможна версия о связи с личным именем. В старину бытовало редкое нецерковное имя Саня (как краткая форма от Александр), и от него могла образоваться фамилия с суффиксом -ин, но в родительном падеже: «Саннин» → со временем «Саннэ» (опять же из-за особенностей произношения). Однако форма «Саннэ» не даёт нам уверенности в суффиксе, поэтому версия с «санями» выглядит проще и логичнее.

Географически фамилия Саннэ встречается единично, в основном на северо-западе России и в Сибири — в тех регионах, где документальная фиксация фамилий была менее строгой и допускала вариативное написание. По сословной принадлежности носители, скорее всего, происходили из крестьян или мещан: фамилии на -ой/-ый редко встречались у дворянства.

Таким образом, Саннэ — не экзотическая иностранная фамилия, а местный, «живой» вариант записи русской фамилии, связанной либо с ремеслом санника, либо с прозвищем по саням. Учитывая редкость, каждый конкретный случай требует проверки по архивным записям: в метрических книгах XIX века она могла писаться и как Санный, и как Саннов, и как Саннэ.