Скорее всего, фамилия Санто является венгерской. Вероятно, она образована от имени Санто — краткой формы латинского имени Сантктикус (Sanctius), которое восходит к слову sanctus - «святой». Следует отметить, что это имя встречается также в Италии, поэтому можно предположить, что основатель рода Санто был итальянцем. По одной из версий, оно происходит от эстонского слова sant, которое переводится на русский язык как «калека, шелудивый». Вполне возможно, что прозвище могло указывать на внешний вид предка, на качества его характера. Также возможно, что прозвище Санто ведёт своё начало от финского слова saanti в значении «приобретение». Не исключено, что основатель рода Санто был весьма зажиточным, богатым человеком.