Фамилия Саныгина — женская форма фамилии Саныгин, которая образована от мужского имени или прозвища Саныга. В основе, скорее всего, лежит просторечная форма крестильного имени Александр — Саня, а суффикс -ыг- выступает как экспрессивный, характерный для северных и сибирских говоров. В диалектах русского языка суффикс -ыг- (-иг-) придавал слову оттенок фамильярности или уменьшительности, как в словах «Ванька» — «Ваньга», «Петька» — «Петьга». Таким образом, Саныга — это не просто «сын Сани», а скорее «Саня, которого по-свойски называли Саныгой».

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным словом «саныга» — так в некоторых областях называли ленивого, нерасторопного человека. Однако в ономастике предпочтение обычно отдают антропонимическому происхождению от имени, поскольку фамилии на -ыгин (-игин) почти всегда восходят к личным именам или прозвищам, а не к нарицательным словам.

Фамилия Саныгин (и Саныгина) встречается в основном в центральной России и Поволжье, но не относится к числу широко распространённых. В архивных записях её можно найти среди крестьянского и мещанского сословий, что типично для фамилий, образованных от уменьшительных форм имён — их часто давали в среде, где не требовалось официального многосложного именования.

Интересно, что фамилия Саныгина стоит в одном ряду с такими же по модели образования, как Вторыгин (от Второй), Косыгин (от Косой), Малыгин (от Малой). Это говорит о том, что суффикс -ыг- был продуктивен в русском бытовом словообразовании, но со временем почти исчез, сохранившись лишь в фамилиях. Поэтому носительница фамилии Саныгина может считать своё родовое имя — реликтом живой народной речи, где Александр превращался в Саныгу, а потом в Саныгина.