Фамилия Сарабуна — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её на части и посмотреть на карту.

Скорее всего, в основе фамилии лежит топоним — название географического объекта. Окончание -а в русских фамилиях обычно указывает на украинское или белорусское происхождение (сравните: Шевченко — Шевченка, Гриценко — Гриценка). Однако в данном случае форма Сарабуна может быть и русифицированной, адаптированной на слух. Корень «сарабун» или «сарабуна» мог быть названием речки, балки или хутора. На юге России и Украины, особенно в степных районах, таких топонимов хватало — часто они восходят к тюркским корням. «Сара» по-тюркски — «жёлтый» или «золотой», «бун» может означать «родник», «источник» или «запруда». Таким образом, Сарабуна могло быть названием «жёлтого родника» или «золотого источника».

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — прозвище. В говорах южнорусских областей словом «сарабуна» могли называть человека с особым говором или манерой поведения, но письменных подтверждений такому слову в диалектных словарях нет. Если бы фамилия была образована от прозвища, она бы скорее имела суффикс -ин (Сарабунин) или -ов (Сарабунов), как «Сын Сарабуны». Форма без суффикса (чистая основа) — явление довольно позднее и редкое для русских фамилий, чаще встречающееся у молдаван или украинцев.

По суффиксу можно сказать, что это модель без патронимического окончания — так называемая «усечённая» фамилия, которую могли дать в канцелярии при переписи, записав прозвище или место жительства как есть. Носители фамилии Сарабуна, вероятно, происходят из одного небольшого региона — возможно, из бывшей Екатеринославской губернии или с Кубани, где тюркские названия особенно распространены. Сословно это могли быть государственные крестьяне или казаки. Точных данных о знаменитых носителях нет, что подтверждает её локальный характер.