Фамилия Сарафинас — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а церковное понятие, причём в форме, которая выдаёт нерусское происхождение носителя. В русской традиции фамилии от слова «серафим» — это Серафимов, Серафимович, Серафимский. Формант -ас указывает на греческое или южнославянское влияние. Скорее всего, перед нами фамилия греческого происхождения, где -ас — типичный суффикс, образующий фамилии от личных имён и прозвищ (ср. греческие фамилии на -опулос, -идис, -ас). Таким образом, Сарафинас — это «сын Серафима» или «человек, связанный с Серафимом».

Основа «Сарафин» — это диалектный или иноязычный вариант церковного имени Серафим. В греческом языке, откуда это имя пришло на Русь, оно звучало как «Серафим», но в устной речи, особенно в среде греческих переселенцев, могло перейти в «Сарафин» под влиянием аканья или местных говоров. Само имя Серафим означает «пламенный, огненный» — так называют высших ангелов в христианстве. Вряд ли предок носителя фамилии был священнослужителем: фамилии на -ас в Греции носили и крестьяне, и горожане. Скорее, основатель рода получил имя Серафим при крещении, а фамилия закрепилась за его потомками.

Географически фамилия Сарафинас встречается в основном в южных регионах бывшей Российской империи и в странах, куда эмигрировали греки: в Греции, на Кипре, в Одесской области Украины, в Краснодарском крае России. В центральной России она практически не фиксируется. Это ещё одно подтверждение версии о греческом корне: в XIX веке в Новороссии и Причерноморье существовали компактные греческие общины, где фамилии на -ас были обычным делом.

Если сравнивать с однокоренными, то Сарафинас стоит особняком. Русские Серафимовы — это патронимы на -ов, указывающие на принадлежность отцу. Серафимские — на -ский, часто искусственные, семинарские фамилии. А Сарафинас — это живая, не книжная форма, сохранившая черты языка той среды, где она возникла. Она не говорит о дворянстве или духовном сословии, но чётко указывает на этническую и региональную принадлежность предков: греческое или эллинизированное население юга Российской империи.