Фамилия Сарафинос — редкий случай в русском ономастиконе. Она происходит не от славянского корня, а от греческого личного имени Серафим (Σεραφείμ), которое в свою очередь восходит к библейскому серафим — «огненный, пламенеющий» (от древнееврейского śārāf — «гореть, сжигать»). В греческой традиции фамилии на -ос (Сарафинос, Пападопулос, Георгиос) оформляли мужские имена и прозвища, указывая на их носителя. То есть Сарафинос — это «Серафимов» по-гречески, где суффикс -ос играет ту же роль, что русский -ов или -ин.

Носители фамилии Сарафинос — почти наверняка потомки греков, переселившихся на территорию Российской империи. Массовые волны греческой миграции пришлись на XVIII–XIX века: после русско-турецких войн греки оседали в Крыму, Приазовье, на юге Украины (Мариуполь, Одесса), а также в городах центральной России. Фамилия могла сохранить греческое окончание -ос, потому что её носители долго держались своей общины, не переоформляя фамилию на русский лад. В отличие от адаптированных вариантов вроде Серафимов или Сарафимов, Сарафинос — маркер этнического происхождения.

В русском языке фамилия выглядит необычно: ударение, скорее всего, падает на второй слог — Сара́финос (как в греческом). На письме возможна путаница с «Серафинос» (через Е), но в русском быту чаще встречается вариант с А — под влиянием аканья или простонародного произношения. Если искать аналоги, то это фамилии вроде Христофорос, Димитриадис, Папагеоргиу — все они указывают на греческие корни и часто сохраняют исходную морфологию.

Сословно предки Сарафинос могли быть купцами, ремесленниками, моряками или священнослужителями — греческие общины в России были разнородны. Но точных данных о конкретном роде занятий без генеалогического исследования нет. Главное, что даёт фамилия сегодня: она почти стопроцентно говорит о греческом происхождении и о том, что предки не стремились русифицировать её, сохранив родовой суффикс.