Фамилия Семагин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Семагин послужило церковное имя Симеон. Семага – это уменьшительная форма имени Симеон, которое в переводе с древнееврейского означает «услышанный Богом в молитве». Веселовского упоминается Семага Клим, холоп, 1596—1603 гг., Новгород. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Семага, со временем получил фамилию Семагин. О точном месте и времени возникновения фамилии Семагин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Семагин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.