Фамилия Семейкин напрямую связана с прозвищем Семейка. Так в старину могли называть не любого человека, а именно главу большого семейства, хозяина, на котором держался весь дом. Само слово «семья» в русском языке восходит к корню «сем», который имеет отношение к семени и продолжению рода, то есть к рождению и воспитанию детей. Именно это традиционно считалось главным предназначением создания семьи, поэтому прозвище Семейка звучало уважительно и указывало на состоявшегося отца и мужа.

В труде историка С. Б. Веселовского упоминаются родственные прозвища и фамилии, которые подтверждают древность этой традиции. Например, Семья Иван Федорович Вельяминов жил во второй половине XV века, а Семьянин Васильевич Артемьев упоминается в 1550 году. Эти примеры показывают, что имя-прозвище Семья и его производные бытовали в разных слоях общества — от знатных родов до служилых людей.

Образование фамилии пошло по классической для русских земель модели: к основе Семейк- добавили притяжательный суффикс -ин, который обозначал принадлежность. Таким образом, Семейкин — это «сын Семейки», «тот, кто из рода Семейкиных». Со временем потомки человека с прозвищем Семейка закрепили за собой это именование как наследственную фамилию. Интересно, что в разных регионах России встречаются однокоренные фамилии — Семейкин, Семьянов, Семьянинов, — и все они восходят к одному корню, но закрепились в разных формах в зависимости от местных говоров и того, как именно называли предка в конкретной местности.