Фамилия Семковская почти наверняка образована от имени Семён, точнее — от его обиходной формы Семко. В старину так могли звать человека в быту, между своими: полное имя звучало торжественно, а короткое Семко приживалось в крестьянской и посадской среде. Имя Семён восходит к древнееврейскому Шимон и означает «услышанный Богом в молитве». От формы Семко через притяжательное прилагательное «Семков» (то есть «сын Семка») и появилась основа, к которой позже добавился суффикс -ск- и окончание -ая. Такая модель типична для фамилий, которые складывались под влиянием польской или украинской традиции, где окончание -ский/-ская изначально указывало на принадлежность к роду или месту.

Есть и вторая версия, которую нельзя сбрасывать со счетов: Семковским могли называть выходца из местечка Семково. Топонимы с таким корнем встречаются не только в России, Белоруссии и на Украине, но даже в Румынии и Болгарии. Если предок переселился из такого села, фамилия отвечала на вопрос «откуда человек?» и закреплялась за ним или его детьми уже на новом месте. Обе гипотезы выглядят равноправно, и выбрать между ними без документов сложно. Процесс формирования фамилий у восточных славян растянулся на несколько столетий, а окончательное закрепление часто зависело от воли помещика, писарей или самого носителя. Поэтому точно сказать, где и когда возник род Семковских, можно только после глубокой генеалогической работы с архивными записями, ревизскими сказками и метрическими книгами. Сама форма Семковская — женская, мужской вариант пишется как Семковский, и это ещё раз напоминает, что фамилия прошла долгий путь от прозвища или указания на место к устойчивому родовому имени.