Фамилия Семйнов — редкий случай, когда написание отрывает её от очевидного источника. Сразу заметна буква «й» перед суффиксом. В русских фамилиях стандартная модель — Семёнов (от имени Семён, народной формы канонического Симеон). Но здесь основа не Семён, а Семй — и это ключевой момент.

Скорее всего, перед нами не ошибка писаря, а результат диалектного произношения или фамилия, образованная от прозвища. В северных и сибирских говорах слово «семья» или «семейный» в быстрой речи могло звучать как «семйа», а человека, обременённого большой семьёй, могли прозвать Семй. Тогда Семйнов — буквально «сын того, кого звали Семй». Фонетически это правдоподобнее, чем вторичное искажение церковного имени.

Менее вероятная, но допустимая версия — украинское или белорусское происхождение. В этих языках имя Семён иногда произносится с твёрдым «м» и последующим «й»: Семій. При русификации фамилия могла записаться как Семйнов, сохранив местный говор. Суффикс -ов указывает на русскую адаптацию, но основа выбивается из привычного ряда.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где оканье и яканье смешивались с северными диалектами: Вологодская, Архангельская области, а также старообрядческие поселения. В документах XIX века такая форма встречается редко, что подтверждает её локальный и, возможно, прозвищный характер.

Таким образом, Семйнов — не просто вариант Семёнова, а самостоятельная фамилия, возникшая из живого произношения. Предок носителя мог быть либо человеком с прозвищем Семй (например, «семьянин»), либо выходцем из западнорусских земель, где имя звучало иначе. В любом случае, написание с «й» — не опечатка, а след языка.