Фамилия Серапина — женская форма, а мужская, соответственно, Серапин. В русской традиции фамилии на -ин обычно образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я, и указывали на принадлежность: «чей?» — Серапин, то есть сын или потомок человека по имени Серапа. Основа здесь — редкое каноническое мужское имя Серапион, которое носил один из раннехристианских святых, епископ Антиохийский. В бытовой речи имя нередко усекали до краткой формы Серапа, от которой и пошла фамилия.

Имя Серапион восходит к греческому Серапис — имени эллинистического божества, совмещавшего черты Осириса и Аписа. В христианском контексте оно утратило языческую окраску и стало восприниматься как вполне церковное, хотя и редкое. В святцах встречается несколько святых с этим именем, поэтому наречение им было допустимо, но встречалось нечасто — отсюда и редкость фамилии.

По словообразовательной модели Серапин стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Антипин (от Антипа), Фокин (от Фока) или Сидорин (от Сидор). Суффикс -ин указывает на древнюю притяжательную форму: в XV–XVII веках так называли крестьян и посадских людей по имени отца или деда. Серапины могли быть выходцами из северных или центральных губерний, где имя Серапион изредка фиксировалось в писцовых книгах.

Спорных версий происхождения у этой фамилии практически нет. Попытки связать её с латинским seraphim («серафим») или с греческим seraph («жгучий») лингвистически неубедительны: в русской ономастике нет переходов «серафим → Серапа», а имя Серапион имеет собственную устойчивую этимологию. Единственный вопрос — могла ли фамилия образоваться напрямую от полной формы имени, минуя усечение. Теоретически возможна фамилия Серапионов, но она ещё реже и, скорее всего, книжного, семинарского происхождения, тогда как Серапин — народная, бытовая форма.

Таким образом, если ваши предки — Серапины, скорее всего, они происходят из среды крестьян или посадских людей, получивших фамилию по имени отца Серапы. Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного очага, что тоже говорит о её редкости.