Фамилия Серганин указывает на происхождение от личного имени или прозвища Серганя. Чаще всего это народная, обиходная форма крестильного имени Сергей, которое возводят к латинскому родовому имени Sergius. В переводе с латыни его нередко трактуют как «высокочтимый» или «высокий», хотя точное значение остается спорным.

В прошлом на Руси имена в официальных документах и в быту часто звучали по-разному. Просторечные формы вроде Серганя возникали естественным путем, как сокращение или ласкательный вариант. Отчество от такой формы — Серганин — постепенно закрепилось и перешло в фамилию, отвечая на вопрос «чей ты?»: сын, внук или потомок человека по имени Серганя.

Модель образования здесь архаичная. Суффикс -ин типичен для русских фамилий, но основа на -аня встречается реже, чем привычные Сергеев или Серёжин. Это говорит о том, что фамилия могла сложиться в среде, где имя бытовало в усеченном, разговорном виде. Иногда такие формы закреплялись за человеком не по святцам, а по домашнему прозвищу, которое со временем вытеснило официальное имя.

Встречаются и другие объяснения, но они менее убедительны. Например, связь с географическими названиями или иноязычными корнями выглядит натянутой, поскольку словообразовательная цепочка Сергей — Серганя — Серганин прослеживается четко и не требует дополнительных допущений.

Сословной привязки у фамилии нет: ее могли носить и крестьяне, и посадские люди. В документах XVII–XIX веков такие фамилии встречаются в разных регионах, но чаще в северных и центральных уездах, где были распространены патронимические формы на -ин. Точных сведений о конкретных носителях в открытых источниках мало, поэтому говорить о знаменитых предках не приходится.

Таким образом, фамилия Серганин — это память о конкретном человеке, которого в семье звали Серганей. Со временем имя забылось, а фамилия осталась напоминанием о том, что предок носил имя, связанное с Сергием, и был, судя по всему, человеком уважаемым в своей округе.