Фамилия Серганюк — характерный пример украинской модели фамилий на -юк, распространенной в западных регионах Украины: на Волыни, Подолье, в Галичине. Суффикс -юк в украинской ономастике выполняет ту же роль, что и русские -ов/-ев или -ин: он указывает на родство, чаще всего на происхождение от отца или главы семьи. Серганюк буквально значит «сын или потомок Сергана», где Серган — это народная, разговорная форма крестильного имени Сергей.

Имя Сергей (церковное Sergius) пришло на Русь из Византии. В украинской среде оно дало множество уменьшительных и производных форм: Серко, Сергун, Серган. Форма Серган — редкая, но вполне естественная для говоров, где согласные смягчаются или, наоборот, отвердевают. От неё и пошла фамилия Серганюк. Интересно, что в некоторых диалектах слово «серган» могло быть и прозвищем, образованным от глагола «сергати» — сердиться, ворчать, но это скорее народная этимология: основная масса носителей фамилии восходит именно к имени Сергей.

В польских и белорусских землях встречается близкая фамилия Серган, а также Серганович. Серганюк — вариант именно украинский, с типичным патронимическим суффиксом. Поскольку фамилия недворянская, её носители в XVII–XIX веках были, скорее всего, крестьянами или казаками, жившими на территории современных Винницкой, Хмельницкой или Ровенской областей. В России фамилия редкая, встречается в основном у потомков переселенцев с Украины.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: корень Серган- плюс суффикс -юк. Ударение, как правило, падает на последний слог: Серганю́к. В документах XIX века могли писать и через «а» (Сарганюк) — из-за аканья в устной речи, но норма закрепилась с «е».