Фамилия Сейдукова — женская форма фамилии Сейдуков, и её разбор стоит начать с вопроса: откуда взялась основа «Сейдук»? В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев, образованных от славянских имён или прозвищ, здесь явно тюркский след. Корень «сейд» или «сеит» восходит к арабскому «саййид» — «господин», «повелитель», почётный титул потомков пророка Мухаммеда. В тюркских языках (особенно у казахов, татар, башкир) слово «сейіт» или «сеит» стало личным именем, а затем и фамильным прозвищем. Суффикс -ук/-ек в таком контексте — типичный тюркский уменьшительно-ласкательный или принадлежностный аффикс, означающий «сын» или «потомок». То есть Сейдук — это буквально «маленький сейид» или «сын сейида».

Если смотреть на географию, то фамилия Сейдукова встречается преимущественно в регионах с татарским, башкирским и казахским населением — в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской, Челябинской областях. Встречается и у ногайцев. Это не случайно: в среде мусульманских народов Поволжья и Урала фамилии на -ов/-ев, приращённые к тюркским именам, стали массово оформляться в XIX веке при переписях и паспортизации. Сейдуков — типичный пример русификации тюркского имени: к основе «Сейдук» добавили русский патронимический суффикс -ов, а в женском варианте — -а.

Интересная деталь: ударение в фамилии обычно падает на второй слог — Сейду́кова, хотя в исходном имени Сейду́к ударение тоже на «у». Это отличает её от фамилий, где ударение смещается на последний слог (например, Сейдуко́в — такое тоже возможно в некоторых диалектах). В ономастических работах (например, у Б. Унбегауна в «Русских фамилиях») подобные модели описаны как «тюркские имена с русским окончанием», и Сейдуков стоит в ряду таких фамилий, как Сейтов, Сейфуллин, Сейдаметов.

Таким образом, предок носительницы фамилии Сейдукова — скорее всего, человек, которого в общине называли Сейдуком, то есть «потомком сейида» или просто человеком с именем Сейит, которое со временем обросло уменьшительной формой. Социально это мог быть как уважаемый старейшина, так и обычный крестьянин, но само имя несло оттенок почтения. Никаких документальных свидетельств о дворянском происхождении нет — это фамилия народная, из крестьянской или казачьей среды.