Фамилия Сейфатова — женская форма, мужской вариант — Сейфатов. В её основе лежит имя Сейфат, которое, в свою очередь, восходит к арабскому корню «сейф» — «меч». Полное имя могло звучать как Сейф ад-Дин («меч веры») или Сайфулла («меч Аллаха»), а Сейфат — его сокращённая, бытовая форма. Такие усечённые имена были распространены у тюркских народов, принявших ислам, особенно среди татар и башкир.

Суффикс -ов (в женском роде -ова) — типичный русский патронимический показатель, который в XVI–XIX веках получали фамилии нерусских народов при взаимодействии с имперской администрацией. То есть предок Сейфатовых был человеком, которого звали Сейфат, а его дети и внуки стали Сейфатовыми. Фамилия не дворянская и не крестьянская в привычном понимании — скорее всего, она принадлежала к слою служилых татар, торговцев или ремесленников, которые вели оседлый образ жизни и фиксировались в метрических книгах.

Интересная деталь: фамилия редкая и географически привязана к регионам с татарским и башкирским населением — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. Встречается и у крымских татар, но там форма могла бы писаться как Сейфат-оглу, а не Сейфатов. Русская паспортная система «перевела» восточное имя в стандартную модель, поэтому сейчас носители фамилии — в основном потомки тех, кто жил в Поволжье или Приуралье.

Если искать однокоренные фамилии, то это Сейфиев, Сейфуллин, Сайфутдинов — все они от того же корня «сейф». Но Сейфатова стоит особняком: она короче, без религиозных добавок, и звучит как чистое прозвище-имя, перешедшее в фамилию.