Фамилия Шабоян — яркий представитель армянской ономастической модели. Её выдают два верных признака: суффикс -ян и основа, которая восходит к армянскому слову «шаб» или «шап» — так в диалектах называли шапку, головной убор. В более широком смысле «шабо» могло означать человека, который носит характерную шапку, либо мастера, который такие шапки шьёт.

Суффикс -ян (в старой орфографии -янц) в армянских фамилиях выполняет ту же роль, что русские -ов и -ин: он указывает на принадлежность к роду. Буквально Шабоян — «из рода Шабо» или «потомок Шабо». Само прозвище Шабо, скорее всего, дали предку по его ремеслу или внешней примете: либо он был шапочником, либо постоянно носил заметный, необычный головной убор. В армянской среде такие прозвища по одежде и аксессуарам — не редкость, они конкретны и легко запоминались соседями.

В отличие от многих фамилий, у которых спорная этимология, Шабоян не даёт простора для альтернативных трактовок. Версия о связи с иранским или тюркским словом «шаб» (ночь) маловероятна — для армянских фамилий это нетипичная основа, и она не объясняет суффиксальную модель. Поэтому самая правдоподобная гипотеза — прозвище от головного убора.

Географически фамилия Шабоян распространена в основном среди армян, происходящих из Западной Армении (исторические области в современной Турции) и из регионов, куда армяне переселялись после геноцида 1915 года — в Армению, Грузию, Краснодарский край, Ростовскую область. В России фамилия встречается, но не входит в число частых, что говорит о её относительно локальном происхождении.

О социальном статусе первых носителей можно судить лишь по основе. Скорее всего, предок Шабоян был ремесленником — шапочником, либо человеком, чья профессия или привычка выделяла его через головной убор. Дворянских корней у фамилии нет: армянские фамилии на -ян в массе своей принадлежали крестьянам и городским ремесленникам, а не знати, которая чаще носила фамилии на -уни или -янц с иной историей.